O Ensino Fundamental II corresponde à segunda etapa deste segmento.  As turmas de 6º ao 9º ano de escolaridade possuem uma Matriz Curricular cujo somatório de tempos de aula soma 27 horas/aula, sendo assim, seu horário semanal de estudos é de 7h às 12h40min.

          Neste segmento, a dinâmica é desenvolvida na parte da manhã, cujo período de aulas é ministrado com cinco tempos diários, porém, dois (02) dias na semana cada turma permanece na escola para que o 6° tempo de aula seja ministrado já que o somatório total semanal necessita de tal dinâmica para distribuir corretamente seus tempos de aula.  O Colégio possui uma equipe multidisciplinar que dá apoio nas aulas ministradas no Laboratório de Informática, Laboratório de Ciências, na Sala de Multimídia e na Sala de Leitura. Todo esse processo é desenvolvido no turno da manhã.